Baru-baru ini,CDC Tiongkok MingguanSebuah artikel penelitian penting telah diterbitkan yang menggambarkan investigasi epidemiologi dan etiologi dari wabah gastroenteritis akut yang disebabkan oleh rotavirus Grup C (RVC) di sebuah sekolah dasar di Luzhou, Provinsi Sichuan, pada Oktober 2025. Yang perlu diperhatikan, kit penangkapan patogen target berkapasitas tinggi (probe-capture) dan teknologi pengurutan pengayaan genom lengkap dari Macro & Micro-Test memainkan peran penting dalam investigasi tersebut. Dengan memungkinkan identifikasi patogen yang akurat dan karakterisasi genom yang komprehensif, teknologi ini memberikan bukti ilmiah penting untuk konfirmasi wabah yang cepat, pelacakan sumber yang tepat, dan pengendalian wabah yang efektif.
Wabah Mendadak: Kasus Wabah RVC Pertama yang Dilaporkan di Tiongkok Barat Daya
Pada tanggal 15 Oktober 2025, terjadi wabah gastroenteritis akut di sebuah sekolah dasar di Luzhou. Sekolah tersebut memiliki total 1.943 siswa dan staf, dengan 32 kasus yang dilaporkan, termasuk 6 kasus yang dikonfirmasi laboratorium dan 26 kasus yang didiagnosis secara klinis, sehingga menghasilkan tingkat serangan keseluruhan sebesar 1,65%. Wabah mencapai puncaknya antara tanggal 15 dan 16 Oktober, dengan Kelas 7, Kelas 5 mengalami tingkat serangan tertinggi (23,08%). Sebagian besar pasien adalah anak-anak usia sekolah (usia rata-rata: 10 tahun), yang terutama menunjukkan gejala muntah (65,62%), diare (46,87%), dan sakit perut (37,50%). Gejala biasanya berlangsung 1–3 hari, dan semua pasien pulih tanpa komplikasi serius.
Investigasi epidemiologi mengidentifikasi kasus indeks sebagai seorang anak laki-laki berusia 11 tahun di Kelas 7, Kelas 5. Adik perempuannya telah mengembangkan gejala serupa sebelum dia, menunjukkan penularan di dalam rumah tangga sebagai sumber awal. Penanganan muntahan yang tidak memadai di lingkungan sekolah—termasuk penyapuan dan pembuangan langsung tanpa disinfeksi tepat waktu atau isolasi area—dikombinasikan dengan kebersihan tangan yang buruk di antara siswa, kemungkinan memfasilitasi penularan lebih lanjut. Sebagian besar ruang kelas yang terdampak terletak di antara lantai dua dan lima dan berbagi toilet pria yang berdekatan, menunjukkan bahwa penularan melalui aerosol dan kontak mungkin telah berkontribusi pada penyebaran tersebut.
Investigasi menjadi sangat menantang karena pemeriksaan patogen rutin, termasuk tes untuk norovirus dan rotavirus Grup A, memberikan hasil negatif, yang menunjukkan bahwa patogen yang tidak umumlah yang bertanggung jawab.
Diagnosis Etiologis: Pengurutan Seluruh Genom Macro & Micro-Test Mengidentifikasi Penyebabnya
Pengujian awal untuk norovirus menunjukkan hasil negatif. CDC Luzhou kemudian menggunakan uji PCR real-time patogen gastrointestinal multipleks yang mampu mendeteksi 28 patogen secara simultan, termasuk 8 virus, 17 bakteri, dan 3 parasit, untuk menyaring delapan sampel klinis. Pada tanggal 17 Oktober, enam sampel dinyatakan positif rotavirus Grup C, sehingga berhasil mengidentifikasi patogen penyebabnya.
Untuk menelusuri lebih lanjut sumber wabah, para peneliti melakukan sekuensing metagenomik nanopore dan sekuensing pengayaan genom lengkap penangkapan probe Macro & Micro-Test pada lima sampel positif. Pendekatan ini berhasil menghasilkan lima sekuens genom RVC lengkap (SC01–SC05). Strategi terintegrasi dari skrining PCR multipleks cepat yang diikuti oleh sekuensing genom lengkap resolusi tinggi memberikan dukungan teknis yang kuat untuk epidemiologi molekuler yang akurat dan penelusuran sumber.
Wawasan Ilmiah: Identifikasi Pertama Genotipe M2 di Tiongkok Barat Daya
Berdasarkan data genom lengkap berkualitas tinggi yang dihasilkan menggunakan teknologi Macro & Micro-Test, tim peneliti melaporkan beberapa temuan ilmiah penting:
Konfirmasi adanya wabah monoklonal:Kelima isolat virus tersebut memiliki genotipe genom lengkap yang identik (G4-P[2]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2), dengan hanya 0–1 perbedaan polimorfisme nukleotida tunggal (SNP), yang secara meyakinkan menunjukkan bahwa wabah tersebut berasal dari satu rantai penularan.
Penemuan genotipe M2:Analisis filogenetik mengungkapkan bahwa strain RVC Luzhou termasuk dalam genotipe M2, bukan genotipe M3 yang sebelumnya dianggap dominan di antara strain RVC Tiongkok. Temuan ini menantang pemahaman konvensional tentang distribusi genotipe RVC di Tiongkok dan menegaskan kemunculan genotipe M2 di Tiongkok barat daya.
Bukti adanya hubungan penularan internasional:Perbandingan seluruh genom menunjukkan kemiripan genetik yang tinggi antara strain Luzhou dan strain RVC yang sebelumnya dilaporkan di Yunnan (2025), Novosibirsk, Rusia (2017), dan Italia (2012), yang menunjukkan adanya jaringan penularan Eurasia yang aktif.
Implikasi bagi Pencegahan dan Pengendalian: Deteksi Dini dan Intervensi Cepat Sangat Penting
Setelah identifikasi patogen, CDC Luzhou segera menerapkan langkah-langkah pengendalian komprehensif, termasuk isolasi kasus, disinfeksi lingkungan, penanganan muntahan yang terstandarisasi, dan penangguhan sementara kegiatan belajar mengajar. Wabah tersebut berhasil dikendalikan dalam satu periode inkubasi, tanpa adanya kasus tambahan yang dilaporkan setelah tanggal 21 Oktober.
Investigasi ini juga memberikan pelajaran penting bagi kesehatan masyarakat: untuk wabah gastroenteritis yang terjadi secara berkelompok dan hasil tesnya negatif untuk rotavirus Grup A dan norovirus, rotavirus Grup C dan rotavirus non-Grup A lainnya harus dimasukkan ke dalam skrining diagnostik rutin.
Studi ini merupakan laporan pertama wabah rotavirus Grup C di Tiongkok barat daya dan identifikasi pertama genotipe M2 di wilayah tersebut, yang memperluas pemahaman saat ini tentang epidemiologi RVC di Asia Timur. Dalam investigasi ini, solusi terintegrasi Macro & Micro-Test yang menggabungkan skrining PCR multipleks dengan pengurutan pengayaan genom lengkap menunjukkan nilai praktis yang signifikan dengan memungkinkan identifikasi patogen yang cepat dan pelacakan sumber molekuler beresolusi tinggi, menyediakan kerangka kerja teknis yang dapat direproduksi untuk investigasi dan pengendalian yang tepat terhadap wabah penyakit menular di masa mendatang.
Waktu posting: 30 Juli 2026